Hệ transcriptome của cà chua phản ứng với mặn dài hạn trong các dòng cải tiến

 Hệ transcriptome của cà chua phản ứng với mặn dài hạn trong các dòng cải tiến

Nguồn: Monther T Sadder, Ahmad Abdelrahim Mohamed Ali, Abdullah A Alsadon, Mahmoud A Wahb-Allah. 2025. Long-Term Salinity-Responsive Transcriptome in Advanced Breeding Lines of Tomato. Plants (Basel); 2025 Jan 1; 14(1):100. doi: 10.3390/plants14010100.

Đất mặn và sự thiếu nước ngọt là hai trở ngại lớn trong môi trường ảnh hưởng bất lợi cho tăng trưởng và phát triển của cây trồng cũng như năng suất trên toàn thế giới. Cà chua (Solanum lycopersicum Mill.) tương đối nhạy cảm với mặn. Xác định gen đích phản ứng với mặn trong cây cà chua, kiểm soát lâu dài tính trạng chống chịu mặn có thể cung cấp những hướng dẫn quan trọng cho chương trình cải tiến giống và công nghệ di truyền. Theo nghiên cứu này, một cách tiếp cận toàn diện của giải trình tự RNA kết hợp với đo lường đặc điểm sinh lý  và nông học được người ta áp dụng trong hai dòng cà chua ưu việt (L46 nhiễm mặn và L56 chống chịu mặn) trong nghiệm thức xử lý ức chế dài hạn về mặn (9.6 dS m-1). Dòng cà chua L56 biểu hiện điều tiết kiểu “up” của các gen DEGs (differentially expressed genes) nổi tiếng và mới biết quy định chức năng chống chịu mặn, được hỗ trợ bởi chỉ số mặn cao (81%). Dòng cà chua L46 biểu hiện cả họ gen giống và khác nhau của bộ gen DEGs. Ví dụ, 22 gen đồng dạng (paralogs) của gen đích mã hóa CBL-interacting kinase biểu thị điều tiết “up” nhiều hơn trong dòng cà chua L56 so với dòng L45. Hơn nữa, dòng L56 khai thác được nhiều hơn SALT OVERLY SENSITIVE paralogs so với dòng L45. Tuy nhiên, cả hai dòng cà chua này đều biểu thị “up-regulation”  mã hóa enzyme “ROS-detoxifying” và “ROS-scavenging proteins” khi bị xử lý stress mặn. Vì vậy, dòng cà chua L56 hiệu quả hơn trong việc truyền đi thông điệp stress  đến nguồn dưới (downstream) trong tất cả chu trình điều tiết có thể có. Dòng cà chua chịu mặn L56 rất mạnh mẽ về di truyền, tăng cường biểu hiện trong hệ thống hoàn chỉnh của các gen phản ứng với  điều kiện bị mặn. Trái lại, dòng cà chua nhiễm mặn L46 cho thấy một vài tiềm năng về di truyền mà thôi. Cả cả dòng cà chua này đều có khả năng lớn trong cải tiến giống cà chua.

Xem https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39795360/

Comments

Post a Comment

Popular posts from this blog

Phân tích đa dạng di truyền và GWAS về tính trạng vitamin C của cải xà lách (Lactuca sativa L.) với bộ chỉ thị SNP

 Phân tích đa dạng di truyền và GWAS về tính trạng vitamin C của cải xà lách (Lactuca sativa L.) với bộ chỉ thị SNP Nguồn:  Inés Medina-Lozano ,  Juan Ramón Bertolín ,  Jörg Plieske ,  Martin Ganal ,  Heike Gnad ,  Aurora Díaz . 2024. Studies of genetic diversity and genome-wide association for vitamin C content in lettuce ( Lactuca sativa  L.) using high-throughput SNP arrays. The Plant Genome; First published: 24 October 2024   Xà lách ( Lactuca sativa  L.) là nguồn thực phẩm cung cấp các dưỡng chất có lợi cho dù chúng thường hiện diện với liều lượng thấp. Người ta sử dụng bộ chỉ thị phân tử  40K Axiom  và  9K Infinium SNP  arrays để (i) khám phá sự đa dạng di truyền của 21 giống canh tác; (ii) thực hiện phân tích GWAS hàm lượng vitamin C  của 21 giống xà lách; quần thể giống xà lách bao gồm 205 cây  co dồi dào nguồn vitamin C (giống Lechuga del Pirineo).   Phân tích kiến trúc di truyền và di truyền h...
Read more

Phân tích transcriptome tính trạng hình thành rễ nhánh sớm của cây cà chua

 Phân tích transcriptome tính trạng hình thành rễ nhánh sớm của cây cà chua Nguồn;  Aiai Zhang ,  Qingmao Shang . 2024. Transcriptome Analysis of Early Lateral Root Formation in Tomato. Plants (Basel); 2024 Jun 12; 13(12):1620. doi: 10.3390/plants13121620.   Rễ mọc ngang (lateral roots:  LR s) thu nhận tín hiệu từ môi trường xuyên hệ thống rễ và hấp thu nước, dưỡng chất từ đất. Auxin điều tiết sự hình thành rễ ngang ấy, nhưng cơ chế này trong cây cà chua chưa  rõ ràng. Nghiên cứu cho thấy:  hệ thống LR của cà chua “Ailsa Craig” xuất hiện vào ngày thứ ba và phân bố không đều trên rễ sơ cấp. Theo vị trí của hệ rễ LR xuất hiện, người ta phân biệt rễ cà chua thành 3 phần bằng nhau: đó là “shootward” (rễ mọc từ thân) ( RB ), “middle part of the root” (giữa rễ) ( RM ), và “tip part of the root” (đỉnh rễ) ( RT ). Mặt cắt ngang của rễ từ ngày 1 đến ngày 6 cho thấy số tế bào  RB  và đường kính rễ gia tăng đáng kể so với  RM  và...
Read more

Thể đa bội trên rau: khám phá di truyền cho sự tiến hóa cây trồng và công tác chọn tạo giống thành công

Image
 Thể đa bội trên rau: khám phá di truyền cho sự tiến hóa cây trồng và công tác chọn tạo giống thành công Một nhóm nghiên cứu đã làm sáng tỏ vai trò của thể đa bội trong quá trình tiến hóa và chọn tạo giống cây rau, tận dụng các công nghệ giải trình tự tiên tiến để phân tích các sắc thái di truyền và biểu sinh của các thể đa bội. Những phát hiện của họ nhấn mạnh sự đóng góp quan trọng của thể đa bội đối với sự đa dạng và khả năng thích ứng của thực vật, làm sáng tỏ “bí ẩn khủng khiếp của Darwin” về sự phát triển của thực vật hạt kín.     Làm nổi bật tiềm năng của thể đa bội trong việc nâng cao năng suất và chất lượng cây trồng, tổng quan này ủng hộ việc ứng dụng trong chọn tạo giống rau để mang lại lợi ích kinh tế và chế độ ăn uống. Bất chấp những bước tiến trong phân tích trình tự và đa omics, những thách thức vẫn tồn tại, bao gồm hiểu biết về tác động toàn diện của đa bội hóa và tận dụng công nghệ đối với các loại cây trồng không thuộc khuôn mẫu.   Nghiên cứu kêu gọ...
Read more