SlJMJ14 được phân lập thông qua “QTL‑seq” và “fine mapping”, điều khiển thời gian trổ bông của cây cà chua

 SlJMJ14 được phân lập  thông qua “QTL‑seq” và “fine mapping”, điều khiển thời gian trổ bông của cây cà chua

Nguồn: Tairu Wu, Baohang Su, He Zhang, Dalong Li, Hanqiao Zhang, Guanglong Xiao, Ao Sun, Tingting Zhao & Xiangyang Xu. 2024. SlJMJ14, identified via QTL‑seq and fine mapping, controls flowering time in tomatoes.

Theoretical and Appled Genetics; September 20 2024; vol.137; article 228

 

Một QTL chủ lực, qLF2.1, đối với tính trạng thời gian trổ cây cà chua, được thực hiện “fine mapped” trên nhiễm sắc thể 2 ở quãng phân tử có độ lớn 51.37 kb, và gen SlJMJ14 được xác minh là gen đích nhờ knockout.

 

Thời gian trổ bông cà chua là tính trạng nông học quan trọng ảnh hưởng đến năng suất, phẩm chất cà chua, và sự thích nghi với môi trường. Theo nghiên cứu này, dòng cận giao “high-generation” số 19108 có kiểu hình trổ muộn được người ta chọn làm “mapping”  gen đích điều khiển tính trạng trổ bông muộn. Trong quần thể con lai F2 dẫn xuất từ 19108 (late flowering) × MM (early flowering), người ta xác định được một QTL chính điều khiển “late-flowering” thông qua kết quả chạy QTL-seq, ký hiệu là qLF2.1. QTL này được “fine mapped” ở quãng phân tử có độ lớn 51.37-kb  thông qua  kết quả phân tích tái tổ hợp. Phân tích chức năng của những gen có tính chất homologous như vậy, Solyc02g082400 (SlJMJ14), mã hóa histone demethylase, người ta xác định đây là gen ứng cử viên triển vọng nhất. Thực hiện “knocking out” gen SlJMJ14 trong MM cho kết quả thời gian trổ bông khoảng 5–6 ngày muộn hơn cây cà chua nguyên thủy (wild-type). Kết quả chỉ ra rằng SlJMJ14 đột biến là QTL chính của kiểu hình trổ bông muộn từ dòng 19108.

 

Xem https://link.springer.com/article/10.1007/s00122-024-04737-3