Fine mapping gen ứng cử viên tại locus qBT2 và qBT7.2 điều khiển thời gian bolting của cây củ cải đỏ (Raphanus sativus L.)

 Fine mapping gen ứng cử viên tại locus qBT2 và qBT7.2 điều khiển thời gian bolting của cây củ cải đỏ (Raphanus sativus L.)

Nguồn: Yueyue Jin, Xiaobo Luo, Yadong Li,  Xiao Peng,  Linjun Wu,  Guangqian Yang, Xiuhong Xu, Yun Pei, Wei Li & Wanping Zhang. 2024. Fine mapping and analysis of candidate genes for qBT2 and qBT7.2 locus controlling bolting time in radish (Raphanus sativus L.). Theoretical and Applied Genetics; January 2024; vol. 137; Article 4

 

Hai QTLs chủ lực điều khiển “bolting time” của cây củ cải đỏ được lập bản đồ di truyền định vị trên nhiễm sắc thể 02 và 07 trong đoạn phân tử có kích thước 0,37 Mb và 0, 52 Mb. Đó là gen RsFLC1 và RsFLC2.

 

Củ cải đỏ (Raphanus sativus L.) là một loài rau trồng quan trọng thuộc họ Thập Tự  Cruciferae. Cây đâm chồi sớm và ra hoa sớm (premature bolting and flowering) sẽ làm giảm năng suất và chất lượng củ cải đỏ. Tuy nhiên, cơ chế phân tử về tính trạng “bolting” và “flowering” như vậy chưa được biết rõ ràng. Quần thể con lai F2 của hai bố mẹ là giống YZH (đâm chồi sớm) × XHT (đâm chồi muộn) được sử dụng để làm nên bản đồ liên kết gen mật độ phân giải cao với giá trị khoảng cách di truyền là 2497,74 cM, trung bình 2,31 cM/quãng. Có tất cả 9 QTLs điều khiển bolting time và 2 QTLs điều khiển flowering time được tìm thấy. Ba QTLs liên quan đến bolting time trong củ cải đỏ đ7ọc xác định bằng phương pháp “QTL-seq” sử dụng quần thể F2 của tổ hợp lai GDE (early bolting) × GDL (late bolting). Kết quả “fine mapping” thu hẹp đoạn phân tử qBT2 và qBT7.2 xuống còn 0,37 Mb và 0,52 Mb trên nhiễm sắc thể 02 và 07, theo thứ tự. Phân tích RNA-seq và qRT-PCR cho kết quả gen RsFLC1 và RsFLC2 là hai gen ứng cử viên đối với locus qBT7.2 và  qBT2, theo thứ tự. Định vị ở mức độ “subcellular” chỉ ra rằng RsFLC1 và RsFLC2 chủ yếu biểu hiện trong nhân. Chèn đoạn phân tử có kích thước1856-bp vào intron đầu tiên của gen RsFLC1 hiển thị chức năng “bolting time”. Sự biểu hiện mạnh mẽ RsFLC2 trong cây mô hình Arabidopsis có ý nghĩa trong việc làm chậm lại thời gian trổ bông. Kết quả sẽ chứng minh được luận điểm mới để khai thác cơ chế phân tử của tính trạng đâm chồi trễ và làm tăng cường hiệu quả MAS (marker-assisted selection) trong chọn tạo giống của cải đỏ “late-bolting”.

 

Xem https://link.springer.com/article/10.1007/s00122-023-04503-x

Comments

Post a Comment

Popular posts from this blog

Phân tích đa dạng di truyền và GWAS về tính trạng vitamin C của cải xà lách (Lactuca sativa L.) với bộ chỉ thị SNP

 Phân tích đa dạng di truyền và GWAS về tính trạng vitamin C của cải xà lách (Lactuca sativa L.) với bộ chỉ thị SNP Nguồn:  Inés Medina-Lozano ,  Juan Ramón Bertolín ,  Jörg Plieske ,  Martin Ganal ,  Heike Gnad ,  Aurora Díaz . 2024. Studies of genetic diversity and genome-wide association for vitamin C content in lettuce ( Lactuca sativa  L.) using high-throughput SNP arrays. The Plant Genome; First published: 24 October 2024   Xà lách ( Lactuca sativa  L.) là nguồn thực phẩm cung cấp các dưỡng chất có lợi cho dù chúng thường hiện diện với liều lượng thấp. Người ta sử dụng bộ chỉ thị phân tử  40K Axiom  và  9K Infinium SNP  arrays để (i) khám phá sự đa dạng di truyền của 21 giống canh tác; (ii) thực hiện phân tích GWAS hàm lượng vitamin C  của 21 giống xà lách; quần thể giống xà lách bao gồm 205 cây  co dồi dào nguồn vitamin C (giống Lechuga del Pirineo).   Phân tích kiến trúc di truyền và di truyền h...
Read more

Mở khóa bí mật về khả năng chịu đựng ức chế mặn ở cây cà chua hoang dã

Image
Mở khóa bí mật về khả năng chịu đựng ức chế mặn ở cây cà chua hoang dã Đa dạng di truyền và cấu trúc của Solanum pimpinellifolium và S. lycopersicum. Nguồn: The Plant Journal (2024). DOI: 10.1111/tpj.16894.   Khi khí hậu thay đổi và độ mặn của đất tăng lên ở nhiều vùng nông nghiệp, việc tìm ra các loại cây trồng có thể phát triển mạnh trong những điều kiện đầy thách thức này là rất quan trọng. Cà chua được canh tác, mặc dù quả cà chua là ngon, nhưng thường gặp trở ngại khi trồng ở điều kiện đất nhiễm mặn. Tuy nhiên, trong quần thể anh em họ hoang dã của chúng đã tiến hóa để tồn tại trong những môi trường đa dạng và thường khắc nghiệt. Một nghiên cứu gần đây đã đi sâu vào bản chất di truyền của cà chua hoang dã để khám phá bí mật về khả năng chịu mặn có thể được sử dụng để phát triển các giống cây trồng có khả năng phục hồi.   Một nhóm các nhà nghiên cứu tập trung vào  Solanum pimpinellifolium , họ hàng hoang dã gần nhất của cây cà chua yêu thích của chúng ta. Những quả nh...
Read more

Phân tích transcriptome tính trạng hình thành rễ nhánh sớm của cây cà chua

 Phân tích transcriptome tính trạng hình thành rễ nhánh sớm của cây cà chua Nguồn;  Aiai Zhang ,  Qingmao Shang . 2024. Transcriptome Analysis of Early Lateral Root Formation in Tomato. Plants (Basel); 2024 Jun 12; 13(12):1620. doi: 10.3390/plants13121620.   Rễ mọc ngang (lateral roots:  LR s) thu nhận tín hiệu từ môi trường xuyên hệ thống rễ và hấp thu nước, dưỡng chất từ đất. Auxin điều tiết sự hình thành rễ ngang ấy, nhưng cơ chế này trong cây cà chua chưa  rõ ràng. Nghiên cứu cho thấy:  hệ thống LR của cà chua “Ailsa Craig” xuất hiện vào ngày thứ ba và phân bố không đều trên rễ sơ cấp. Theo vị trí của hệ rễ LR xuất hiện, người ta phân biệt rễ cà chua thành 3 phần bằng nhau: đó là “shootward” (rễ mọc từ thân) ( RB ), “middle part of the root” (giữa rễ) ( RM ), và “tip part of the root” (đỉnh rễ) ( RT ). Mặt cắt ngang của rễ từ ngày 1 đến ngày 6 cho thấy số tế bào  RB  và đường kính rễ gia tăng đáng kể so với  RM  và...
Read more