QTLs điều khiển tính trạng hạt cà chua

QTLs điều khiển tính trạng hạt cà chua

Nguồn: Mark G. Sterken, Harm Nijveen, Martijn van Zanten, Jose M. Jiménez-Gómez, Nafiseh Geshnizjani, Leo A. J. Willems, Juriaan Rienstra, Henk W. M. Hilhorst, Wilco Ligterink & Basten L. Snoek. 2023.  Plasticity of maternal environment-dependent expression-QTLs of tomato seeds. Theoretical and Applied Genetics volume 136, Article number: 5 (2023); Published: 22 February 2023.

 

Hạt rất cần đề làm giống cho vụ sau, duy trì thông tin di truyền. Khả năng nẩy mầm của hạt và sự phát triển cây non khỏe mạnh tùy thuộc vào phẩm chất hạt cộng với yếu tố môi trường ví dụ như dinh dưỡng. Cà chua (Solanum lycopersicum) và nhiều loài cây khác được người ta quan tâm nhiều đến phẩm chất hạt và đặc điểm của phát triển cây non, bởi biến dị di truyền cũng như môi trường dinh dưỡng của cây mẹ ở đó, hạt giống được phát triển và chín sinh lý. Đóng góp của di truyền biến thiên khác lớn đối với phẩm chất hạt và phẩm chất cây non gắn với đáp ứng của môi trường. Tất cả có thể được dự đoán ở mức độ transcriptome của hạt khô thông qua các loci được lập bản đồ trên genome mà những loci ấy ảnh hưởng đền biểu hiện gen (biểu hiện QTLs) phản ánh môi trường cây mẹ sinh sống. Theo kết quả nghiên cứu, người ta áp dụng kỹ thuật “RNA-sequencing” để thiết kế một bản đồ di truyền kiểu “linkage map”, xác định biểu hiện gen của hạt thuộc quần thể con lai cận giao tái tổ hợp (RIL: recombinant inbred line) dẫn xuất từ tổ hợp lai giữa S. lycopersicum (cv. Moneymaker) x S. pimpinellifolium (G1.1554). Hạt chín cây trong những nghiệm thức khác nhau về dinh dưỡng, i.e., nghiệm thức lân cao hoặc nghiệm thức đạm thấp. Chỉ thị phân tử SNPs (single-nucleotide polymorphisms) được sử dụng phục vụ bản đồ di truyền này. Nền tảng di truyền mang tính chất thích ứng (genetic landscape of plasticity) trong nội dung điều tiết biểu hiện gen (gene regulation) tính trạng hạt khô, bị ảnh hưởng bởi mội trường dinh dưỡng cây mẹ (maternal nutrient environment). Thông tin tổng hợp lại về biến dị di truyền đáp ứng với môi trường có thể góp phần giúp chúng ta hiểu rõ hơn trong chương trình cải tiến giống thích ứng với điều kiện ngoại cảnh.

 

Xem https://link.springer.com/article/10.1007/s00122-023-04322-0

Comments

Post a Comment

Popular posts from this blog

Phân tích đa dạng di truyền và GWAS về tính trạng vitamin C của cải xà lách (Lactuca sativa L.) với bộ chỉ thị SNP

 Phân tích đa dạng di truyền và GWAS về tính trạng vitamin C của cải xà lách (Lactuca sativa L.) với bộ chỉ thị SNP Nguồn:  Inés Medina-Lozano ,  Juan Ramón Bertolín ,  Jörg Plieske ,  Martin Ganal ,  Heike Gnad ,  Aurora Díaz . 2024. Studies of genetic diversity and genome-wide association for vitamin C content in lettuce ( Lactuca sativa  L.) using high-throughput SNP arrays. The Plant Genome; First published: 24 October 2024   Xà lách ( Lactuca sativa  L.) là nguồn thực phẩm cung cấp các dưỡng chất có lợi cho dù chúng thường hiện diện với liều lượng thấp. Người ta sử dụng bộ chỉ thị phân tử  40K Axiom  và  9K Infinium SNP  arrays để (i) khám phá sự đa dạng di truyền của 21 giống canh tác; (ii) thực hiện phân tích GWAS hàm lượng vitamin C  của 21 giống xà lách; quần thể giống xà lách bao gồm 205 cây  co dồi dào nguồn vitamin C (giống Lechuga del Pirineo).   Phân tích kiến trúc di truyền và di truyền h...
Read more

Mở khóa bí mật về khả năng chịu đựng ức chế mặn ở cây cà chua hoang dã

Image
Mở khóa bí mật về khả năng chịu đựng ức chế mặn ở cây cà chua hoang dã Đa dạng di truyền và cấu trúc của Solanum pimpinellifolium và S. lycopersicum. Nguồn: The Plant Journal (2024). DOI: 10.1111/tpj.16894.   Khi khí hậu thay đổi và độ mặn của đất tăng lên ở nhiều vùng nông nghiệp, việc tìm ra các loại cây trồng có thể phát triển mạnh trong những điều kiện đầy thách thức này là rất quan trọng. Cà chua được canh tác, mặc dù quả cà chua là ngon, nhưng thường gặp trở ngại khi trồng ở điều kiện đất nhiễm mặn. Tuy nhiên, trong quần thể anh em họ hoang dã của chúng đã tiến hóa để tồn tại trong những môi trường đa dạng và thường khắc nghiệt. Một nghiên cứu gần đây đã đi sâu vào bản chất di truyền của cà chua hoang dã để khám phá bí mật về khả năng chịu mặn có thể được sử dụng để phát triển các giống cây trồng có khả năng phục hồi.   Một nhóm các nhà nghiên cứu tập trung vào  Solanum pimpinellifolium , họ hàng hoang dã gần nhất của cây cà chua yêu thích của chúng ta. Những quả nh...
Read more

Phân tích transcriptome tính trạng hình thành rễ nhánh sớm của cây cà chua

 Phân tích transcriptome tính trạng hình thành rễ nhánh sớm của cây cà chua Nguồn;  Aiai Zhang ,  Qingmao Shang . 2024. Transcriptome Analysis of Early Lateral Root Formation in Tomato. Plants (Basel); 2024 Jun 12; 13(12):1620. doi: 10.3390/plants13121620.   Rễ mọc ngang (lateral roots:  LR s) thu nhận tín hiệu từ môi trường xuyên hệ thống rễ và hấp thu nước, dưỡng chất từ đất. Auxin điều tiết sự hình thành rễ ngang ấy, nhưng cơ chế này trong cây cà chua chưa  rõ ràng. Nghiên cứu cho thấy:  hệ thống LR của cà chua “Ailsa Craig” xuất hiện vào ngày thứ ba và phân bố không đều trên rễ sơ cấp. Theo vị trí của hệ rễ LR xuất hiện, người ta phân biệt rễ cà chua thành 3 phần bằng nhau: đó là “shootward” (rễ mọc từ thân) ( RB ), “middle part of the root” (giữa rễ) ( RM ), và “tip part of the root” (đỉnh rễ) ( RT ). Mặt cắt ngang của rễ từ ngày 1 đến ngày 6 cho thấy số tế bào  RB  và đường kính rễ gia tăng đáng kể so với  RM  và...
Read more